Universitarios obtienen trofeo por método para identificar origen de bacterias resistentes a antibióticos

Universitarios obtienen trofeo por método para identificar origen de bacterias resistentes a antibióticos

Con un método innovador para llevar a cabo la caracterización de muestras genéticas de microorganismos y su resistencia a antibióticos, colectados en distintos sistemas de transporte colectivo en el mundo, un equipo multidisciplinario e interinstitucional encabezado por científicas de la UNAM, obtuvo el Trofeo CAMDA 2023.

Esta distinción certifica que se cuenta con la capacidad y los expertos para conducir el análisis masivo de datos genómicos, al mismo nivel que naciones desarrolladas, afirmó la investigadora del Centro de Ciencias Matemáticas (CCM) de la Universidad Nacional Autónoma de México, Nelly Sélem Mojica, responsable de la organización y coordinación del proyecto, el cual triunfó al superar a representantes de países como Australia, Alemania y Polonia.

Se trata de la primera vez que un conjunto mexicano participa en el prestigiado certamen; además, México fue el único país de Latinoamérica en asistir con dos equipos al encuentro realizado en la ciudad de Lyon, Francia, el 27 de julio pasado.

El equipo ganador estuvo conformado por 26 integrantes de entidades de la UNAM: el CCM y la Escuela Nacional de Estudios Superiores (ENES), ambos en el campus Morelia; así como del Instituto de Ciencias del Mar y Limnología (ICML). De igual manera, por instituciones externas: los centros de Investigación en Matemáticas (CIMAT) y el de Investigación y Estudios Avanzados (CINVESTAV).

También se contó con representantes del proyecto Alianza Innovación Huawei de Microbiomas de Rizósfera, además de trabajadores de las empresas C3, Amphora y Bimbo, donde se realizan análisis de datos biológicos.

Sélem Mojica, experta en biomatemáticas, tuvo la iniciativa de convocar a estudiantes de licenciatura y posgrado de distintas dependencias educativas y de investigación, así como a expertos del sector privado, a participar en un hackatón que con el apoyo del CCM y de la Sociedad Matemática Mexicana tuvo lugar del 3 al 7 de julio pasado, en las instalaciones del CCM, en el que se reunieron los integrantes del equipo para resolver uno de los retos que la CAMDA propuso.

Analizaron datos masivos de muestras genéticas de microorganismos, colectadas en distintos sistemas de transporte colectivo en el mundo, al igual que genomas provenientes de hospitales para investigar la resistencia de los microorganismos a los antibióticos en distintas especies.

Con los resultados obtenidos enviaron una propuesta de proyecto preliminar al comité organizador de la Conferencia Internacional de ISCB, el cual determinó que el trabajo del grupo mexicano sería uno de los que competiría por el Trofeo CAMDA.

En representación del equipo asistieron a la citada ciudad francesa: Adriana Haydeé Contreras Peruyero, investigadora posdoctoral en el CCM; y Mirna Vázquez Rosas Landa, investigadora del ICML, quienes presentaron, respectivamente, el póster y la ponencia, ante expertos internacionales.

Esta distinción del Evaluación Crítica del Análisis Masivo de Datos (CAMDA por sus siglas en inclés) es el máximo reconocimiento que otorga la Sociedad Internacional de Biología Computacional (ISCB) al proyecto que resuelva, de manera sobresaliente, alguno de los retos propuestos: predecir la ciudad de origen de ciertos aislados bacterianos utilizando su perfil antimicrobiano y/o el desafío forense para identificar el origen de la ciudad utilizando los perfiles taxonómicos y funcionales obtenidos de los metagenomas.